Hallo Manuel,
nach Elounda (von dort mit dem Boot rüber zur Insel) ist es ca. eine Stunde Fahrzeit (siehe Google Maps), ist auch gut zu kombinieren mit einem Besuch in Ag. Nikolaos (und Kritsa/Lato).
Samaria-Schlucht machst du am besten als organisierte Tour (über örtl. Veranstalter per Bus), da du zunächst nach Chania und von dort hoch in die Berge nach Omalos musst (Google Maps).
Nach der Wanderung und der Schiffsfahrt von Ag. Roumeli nach Chora Sfakion (Wanderung+Schiff) muss man dann wieder hoch zur Nordküste und schließlich den gleichen Weg wieder zurück (Rückweg).
Weitere Infos zur Samaria findest du in den Kreta-Impressionen: Link